Modele de sucre d`orge

Analyse phylogénétique bayésienne des principales protéines intrinsèques de l`orge (MIPs). Les séquences de protéine MIP de l`orge ont été alignées avec les MIPs de l`Arabidopsis, du maïs et du riz à l`aide de ClustalW. Les MIPs d`orge analysés sont mis en évidence. Les annotations et les séquences protéiques sont données dans le fichier supplémentaire S2 à JXB en ligne. Concernant HvNIP2; 1, la Fig. 2 fait référence au gène annoté d`abord (numéro d`accession BA166444) et non au gène mentionné par Schnurbusch et coll. (2010) comme transporteur de bore (HvNIP2; 1). Ce dernier gène est identique en séquence au transporteur de silicium (HvLsi1, illustré) rapporté par Chiba et coll. (2009). HvSIP2; 1 n`est pas annotée; seule une séquence partielle est connue, ce qui montre l`homologie la plus élevée à AtSIP2; 1 parmi les SIPs d`Arabidopsis. L`échelle de distance représente la distance évolutive, exprimée en nombre de substitutions par acide aminé. Les chiffres affichés sur les noeuds principaux reflètent la probabilité postérieure.

Orge (Hordeum vulgare L. CV. golf (Svalöf Weibull AB, Svalöv, Suède)) les plantes ont été cultivées hydroponiquement dans une chambre de croissance comme décrit précédemment sous une période de 16/8 h (Knipfer et Fricke, 2010). Les plants ont été analysés lorsqu`ils étaient âgés de 14 à 16 d. À ce stade de développement, le principal système racinaire consistait en racines séminales, les racines adventives commençant à se développer. La feuille trois était allongée à 2 – 3 mm h − 1 et était de 12 – 19 cm de long, dont 7 – 8 cm étaient enfermés dans et 5 – 11 cm émergea de la gaine de la feuille deux. Les séquences d`amorce utilisées pour isoler les gènes candidats sont répertoriées dans le dossier supplémentaire S1 à JXB en ligne. BarleyBase (http://www.barleybase.orgShen et coll., 2005) a été projeté pour les séquences contig en utilisant des mots-clés tels que`aquaporin`, `canal d`eau`, `TIP`, et`PIP` (voir aussi Richardson et al., 2007a). Des séquences ont été examinées pour l`existence du motif NPA/NPX caractéristique des MIPs. Des séquences complètes ont été obtenues à partir de la base de données NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), et les amorces ont été conçues pour cloner une sélection d`aquaporines, en utilisant l`ADNc qui avait été synthétisé à partir d`ARN extrait de semis d`orge âgés de 2 semaines. Le cadre de lecture ouvert a été amplifié par PCR en utilisant la preuve de lecture polymérase KOD Hot Start DNA polymérase (Merck, Darmstadt, Allemagne). Le produit PCR a été cloné dans l`entrée de la passerelle Vector pCR® 8/GW/TOPO® (pCR® 8/GW/TOPO® TA clonage® Kit, Invitrogen), et l`insert vérifié par séquençage.

La colonne Solomonique, également appelée colonne orge-sucre, est une colonne hélicoïdale, caractérisée par un arbre de torsion en spirale comme un tire-bouchon. Il n`est pas associé à un ordre classique spécifique, bien que la plupart des exemples aient des capitales corinthes ou composites. Mais il peut être couronné avec n`importe quel design, par exemple, en faisant une colonne romaine solomonique dorique ou ionique solomonique. des expériences de microarray, utilisant une puce Affymetrix d`orge (Close et al., 2004), ont été effectuées pendant 2004/2005 dans le cadre d`une étude sur le développement de la cuticule chez l`orge (Richardson et al., 2007a). Les plantes utilisées pour les analyses de microarray avaient été cultivées dans des conditions similaires et contrôlées et avaient le même âge de développement que les plantes analysées dans la présente étude.